Perkembangan tanaman transgenik dapat diterima dengan baik oleh Amerika Syarikat, Argentina, China, dan Kanada.[36] Namun, banyak negara Eropah yang menolak tanaman transgenik kerana kebimbangan terhadap potensi gangguan kesihatan pengguna dan kerosakan alam sekitar.[36]

Pengaruh pada kesihatan manusia

Sikap kontra terhadap produk tanaman transgenik biasanya berasal daripada organisasi bukan kerajaan/NGO, seperti Greenpeace dan Friends of the Earth Antarabangsa.[37] Dari segi kesihatan, tumbuhan ini dianggap boleh menjadi alergen baru bagi manusia.[5] Untuk bertindak balas terhadap hal tersebut, para penyelidik mengatakan bahawa sebelum suatu tanaman transgenik dihasilkan secara besar-besaran, pelbagai ujian potensi alergi dan ketoksikan akan dilakukan untuk memastikan agar produk tanaman tersebut selamat untuk dimakan.[4] Apabila berpotensi menyebabkan alahan, makan tanaman transgenik tersebut tidak akan dikembangkan lebih lanjut.[38] Kebimbangan lain yang timbul dalam masyarakat adalah kemungkinan gen asing pada tanaman transgenik boleh berpindah ke tubuh manusia apabila dimakan.[38] Pendapat tersebut dinilai berlebihan oleh para saintis kerana makanan yang berasal daripada tumbuh-tumbuhan transgenik akan terurai menjadi unsur-unsur yang dapat diserap tubuh sehingga tidak akan terdapat gen aktif.[38] Untuk memberikan kebebasan kepada masyarakat dalam memilih produk transgenik atau produk semula jadi, pelbagai negara, khususnya negara-negara Eropah, telah melakukan pemberian label terhadap produk transgenik.[39][40] Pelabelan tersebut juga bertujuan untuk memberikan maklumat kepada pengguna sebelum mengambil hasil tanaman transgenik.[39] Dan boleh menimbulkan ketumbuhan, hasil ini telah diuji oleh seorang saintis terhadap tikus yang diberi makan jagung transgenik semasa beberapa waktu mengalami tumor di buah pinggang dan hatinya.[41] Namun penelitian yang dilakukan Gilles-Éric Séralini ini memiliki kontroversi.[42]

Pengaruh pada ekologis

Penolakan terhadap penanaman tanaman transgenik muncul kerana dianggap berpotensi mengganggu keseimbangan ekosistem. Salah satunya adalah terbentuknya perosak atau rumpai super (yang lebih kuat atau resisten) di lingkungan.[5] Kebimbangan ini terlihat jelas pada perdebatan mengenai jagung transgenik yang mempunyai racun transgenik untuk membunuh perosak lepidoptera berupa rama-rama dan kupu-kupu tertentu.[43] Ada kemungkinan perosak yang ingin dibunuh dapat menyesuaikan diri dengan tanaman tersebut dan menjadi perosak yang lebih tahan atau kebal terhadap racun transgenik.[5] Selain itu, rama-rama Monarch, yang bukan merupakan perosak jagung, turut terkena kesan berupa peningkatan kematian akibat memakan daun tumbuhan pokok renek (Asclepias) yang terkena debunga jagung transgenik.[4] Penyelidikan mengenai rama-rama Monarch tersebut dapat disanggah oleh kajian lain yang menyatakan bahawa kupu-kupu tersebut mati kerana habitat mereka dirosakkan dan hal ini tidak berkaitan sama sekali dengan jagung transgenik.[3] Di sisi lain, penggunaan tanaman transgenik seperti jagung transgenik telah menurunkan penggunaan racun perosak secara signifikan sehingga mengurangkan pencemaran kimia ke alam sekitar.[4] Selain itu, petani juga merasakan kesan ekonomi dengan penjimatan kos pembelian racun perosak.[4]

Kontroversi lain yang berkaitan dengan isu ekologi adalah timbulnya perpindahan gen secara tidak terkawal dari tanaman transgenik ke tanaman lain dalam alam melalui pendebungaan.[38] Debunga dari tanaman transgenik boleh dibawa angin dan haiwan hingga menghinggap tanaman lain.[38] Akibatnya, boleh terbentuk tumbuhan baru dengan sifat yang tidak dijangka dan berpotensi merugikan persekitaran.[38] Sebagai langkah berjaga-jaga, beberapa tanaman yang dimasuki gen untuk mempercepat pertumbuhan dan pembiakan tanaman, seperti: alfalfa (Medicago sativa), kanola, bunga matahari, dan padi, disyorkan untuk ditanam pada daerah tertutup (terlindung) atau dihadkan dengan daerah penghalang.[4][5] Hal itu dilakukan untuk menekan perpindahan debunga ke tanaman lain, terlebih rumpai.[4] Apabila rumpai mempunyai gen tersebut maka pertumbuhannya akan semakin tidak terkawal dan dengan cepat boleh merosakkan pelbagai daerah pertanian dalam sekitarnya.[4] Hingga kini belum terdapat petunjuk bahawa pemindahan mendatar ini telah menyebabkan munculnya "rumpai super", walaupun telah diketahui berlaku pemindahan mendatar.

Pengaruh etika dan agama

Dari segi etika, pihak yang kontra dengan tanaman transgenik menganggap bahawa kejuruteraan atau manipulasi genetik tanaman merupakan tindakan yang tidak menghormati ciptaan Tuhan.[44] Perubahan sifat tanaman dengan penambahan gen asing juga dianggap sebagai tindakan "bermain sebagai Tuhan" kerana mengubah makhluk yang telah diciptakan-Nya.[45] Pemikiran teologis Katolik memandang bahawa manipulasi atau kejuruteraan genetik merupakan suatu kemungkinan yang disediakan oleh Tuhan kerana tanaman diberikan kepada manusia untuk dipelihara dan dimanfaatkan mengubah makhluk.[44] Dalam sudut pandang agama tersebut, pengubahsuaian genetik tanaman tidak bertentangan dengan ajaran Gereja Katolik, namun kelestarian alam juga harus diperhatikan kerana ia merupakan tanggungjawab manusia.[46] Dalam respons kepada isu tentang tanaman transgenik, Dewan Undang-undang Islam dan Badan Pensijilan Makanan Islam di Amerika (IFANCA) menyatakan bahawa makanan daripada tumbuh-tumbuhan transgenik telah dibangunkan bersifat halal dan boleh digunakan oleh umat Islam.[47] Untuk tanaman yang dimasukkan gen daripada binatang haram, produk tanaman transgenik tersebut akan dipanggil Masbuh, yang bererti masih ragu-ragu (belum diketahui) status halal atau haramnya.[47] Pensijilan makanan yang telah dikeluarkan oleh IFANCA juga diiktiraf dan diterima oleh Majelis Ulama Indonesia (MUI), Majlis Ulama Islam Singapura (MUIS), Liga Muslim Dunia, Arab Saudi, dan kerajaan Malaysia.[47]

Pihak yang menyokong tanaman transgenik menganggap bahawa pemindahan gen daripada suatu makhluk hidup ke makhluk lainnya merupakan perkara yang semula jadi dan biasa terjadi sejak pertama kali berlangsungnya kehidupan.[3] Mereka juga mendakwa bahawa kacukan pelbagai jenis padi yang dilakukan untuk mendapatkan padi dengan sifat unggul telah dilakukan para petani sejak dahulu.[3] Perkahwinan pelbagai jenis padi tanpa disedari telah mencampur gen-gen yang terdapat di tanaman tersebut.[3] Para saintis hanya mempercepatkan proses pemindahan gen tersebut secara sengaja dan sistematik.[3]

Pengaruh terhadap ekonomi global

Penyelidikan dan pembangunan tanaman transgenik memerlukan kos yang besar dan biasanya dilakukan oleh syarikat-syarikat swasta mahupun kerajaan di negara maju.[5] Untuk mengembalikan bayaran pelaburan syarikat dan melindungi produk hasil pelaburannya, tanaman transgenik yang telah dihasilkan akan dipatenkan.[48] Pada dalam salah satu laporan kerja Suruhanjaya Eropah, dinyatakan bahawa penguatkuasaan paten pada produk transgenik boleh mengakibatkan petani kehilangan kemampuan menghasilkan benih secara mandiri dan harus membeli pada pengeluar dari negara maju.[49] Kebergantungan para petani terhadap pengeluar juga semakin meningkat dengan penemuan teknologi "gen bunuh diri".[5] Sebahagian tanaman transgenik dimasukkan "gen bunuh diri" yang menyebabkan tanaman hanya dapat ditanam sekali dan biji keturunan selanjutnya bersifat mandul (tidak boleh berkembang biak).[48] Hal ini akan menyebabkan terjadinya arus modal daripada negara membangun ke negara maju untuk pembelian benih transgenik setiap kali akan melakukan penanaman.[5] Para petani di negara-negara dunia ketiga bimbang apabila harga benih akan menjadi mahal kerana penguatkuasaan paten dan mekanisme "gen bunuh diri" yang dilakukan oleh pengeluar benih.[48] Jika petani tersebut tidak mampu membeli benih transgenik maka jurang ekonomi antara negara pengeluar tanaman transgenik dan negara membangun sebagai pengguna akan semakin melebar.[5] Salah satu usaha mencegah terjadinya jurang tersebut pernah dilakukan oleh Yayasan Rockefeller.[48] Yayasan yang berpusat di Amerika Syarikat tersebut telah menjual benih transgenik dengan harga yang lebih murah kepada negara-negara miskin.[48]

Pada beberapa negeri Brazil, larangan tanaman transgenik telah mengakibatkan terjadinya penyeludupan benih transgenik oleh para petani di negara tersebut.[48][50] Mereka takut menderita kerugian ekonomi apabila tidak mampu bersaing di pasaran global dengan negara pengeksport bijirin lain.[48]